Geometrická morfometrie

Václav Krajíček, Vaclav.Krajicek at mff.cuni.cz

Slidy k přednášce (zimní semestr 2010)

• Seminář o software pro 2D geometrickou morfometrii
• Přednáška 1 - Úvod, Landmarkové metody, Dvoubodová registrace
• Přednáška 2 - Prokrustovská analýza, Teorie tvaru, TPS
• Přednáška 3 - Warps, FESA, PCA
• Přednáška 4 - Výpočet PCA, Statistika v kostce, Statistické testy, Regresní analýza
(opraveno, slide 10)
• Přednáška 5 - Nelandmarkové metody, Křivky, Analýza kontur, Semilandmarky, Integrální transformace

Ukázkové skripty (vypracovany v programu Matlab, po upravach funkcni i v programu Octave)

• Ukázkové skripty včetně použitých dat

Doporučená literatura

• Zelditch, Swiderski, Sheets, Fink: Geometric Morphometrics for Biologists: A Primer
• D.E. Slice: Modern Morphometrics in Physical Anthropology
• S. R. Lele, J. T. Richtsmeier: An Invariant Approach to Statistical Analysis of Shapes
• Fred. L. Bookstein: Morphometric Tools for Landmark Data Geometry and Biology
• Gonick L., Smith W.: Cartoon guide to statistics
• Claude J.: Morphometrics with R

Užitečné odkazy

• SUNY Stony Brook morphometrics

Doporučené programy

• PAST
• The R Project for Statistical Computing
• Octave
• tps suite